В Бельгии и Финляндии растение входит в государственную фармакопею, рекомендовано официальной медициной в качестве жаропонижающего, противовоспалительного, обезболивающего средства. Используется при стенокардии, головных болях, глистных инвазиях. Также в этих странах применяется пижма при месячных для уменьшения кровотечения или полной остановки менструаций.
В немецкой и официальной российской медицине показания к приему пижмы ограничены заболеваниями желудочно-кишечного тракта и глистными инвазиями.Беременным строго противопоказана пижма, поскольку она обладает абортивным действием — тонизирует мускулатуру матки. Детям младшего возраста (до 3 лет) нельзя принимать пижму ввиду её токсичности. Нельзя применять пижму, если имеются камни в желчном пузыре, гипертоническая болезнь, аллергия на химический состав пижмы.
За рекомендацией в применении пижмы при конкретном заболевании следует обратиться к врачу.